Основные профессиональные образовательные программы, доступные в Томском колледже гражданского транспорта:
- Строительство и эксплуатация автомобильных дорог и аэродромов.
- Техническое обслуживание и ремонт автомобильного транспорта.
- Техническая эксплуатация подъемно-транспортных, строительных, дорожных машин и оборудования (по отраслям).
- Автомеханик.
Дополнительная профессиональная программа (программа повышения квалификации) «Нормативно-правовые основы предоставления услуг для инвалидов и оказания им ситуационной помощи на общественном транспорте».
Томский колледж гражданского транспорта является площадкой регионального чемпионата "Молодые профессионалы (WorldSkills Russia)" в Томской области по компетенции "Ремонт и обслуживание легковых автомобилей" , а также площадкой регионального этапа Всероссийской олимпиады профессионального мастерства обучающихся по специальностям среднего профессионального образования (профильное направление – УГС 23.00.00 Техника и технологии наземного транспорта, специальности 23.02.03 "Техническое обслуживание и ремонт автомобильного транспорта" и 23.02.01 "Организация перевозок и управление на транспорте".